برهم‌کنش پلیمرهای حلقوی در کانال دو بعدی

سرابادانی, جلال

doi:10.47176/ijpr.19.3.35381

برهم‌کنش پلیمرهای حلقوی در کانال دو بعدی

نویسنده

جلال سرابادانی

پژوهشکده علوم نانو، پژوهشگاه دانش‌های بنیادی، تهران

https://doi.org/10.47176/ijpr.19.3.35381

چکیده

با استفاده از شبیه‌سازی به روش دینامیک مولکولی برهم‌کنش بین دو زنجیره پلیمر حلقوی، که در ناحیه بین دو دیواره کانال دوبعدی قرار گرفته‌اند، مورد بررسی قرار می‌گیرد. یک مونومر از هر زنجیره در فاصله برابر از هر یک از دیواره‌های کانال ثابت شده است. شبیه‌سازی‌ها نشان می‌دهند که نیروی بین دو پلیمر دافعه است و به طور متوسط بدون توجه به مقدار ضخامت کانال، با عکس فاصله بین دو مونومر ثابت شده افت می‌کند. به علاوه نیرویی که از افت و خیز شکل هندسی پلیمرها به دیواره‌های کانال وارد می‌شود نیز دافعه بوده، بدون توجه به مقدار فاصله بین دو مونومر ثابت شده، به طور متوسط با عکس مکعب ضخامت کانال افت می‌کند.

p { margin-bottom: 0.08in; direction: ltr; color: rgb(0, 0, 0); }p.western { font-family: "Times New Roman", serif; font-size: 12pt; }p.cjk { font-family: "Times New Roman", serif; font-size: 12pt; }p.ctl { font-family: "Times New Roman", serif; font-size: 12pt; }a:link { color: rgb(0, 0, 255); }

کلیدواژه‌ها

پلیمر

افت‌و‌خیز

دینامیک مولکولی

شبیه‌سازی

عنوان مقاله English

Interaction of ring polymers in two-dimensional channel

نویسنده English

J Sarabadani

چکیده English

The interaction between two ring polymer chains located in the area between two dimensional channel walls is investigated using molecular dynamics simulation. One monomer of each chain is fixed at an equal distance from each of the channel walls. The simulations show that the force between the two polymers is repulsive; on average, irrespective of the channel thickness, it decreases with the increase of the distance between the two fixed monomers. In addition, the force applied to the channel walls by the geometrical fluctuations of the polymers is also repulsive, regardless of the distance between the two fixed monomers, such that, on average, it is decreased with the cubic inverse of the channel thickness.

کلیدواژه‌ها English

polymer

fluctuation

molecular dynamics

simulation

1. B Alberts, A Johnson, J Lewis, M Raff, K Roberts, and P Walter, “Molecular Biology of the Cell”, Garland Science (2002). 2. A Gholami, J Wilhelm, and E Frey, Phys. Rev. E 74, 041803 (2006). 3. M Aliee and A Najafi, Phys. Rev. E 78 (2008) 051802. 4. A Milchev, J. Chem. Phys. 143 (2015) 064701. 5. F Varnik, J Baschnagel, and K Binder, J. Chem. Phys. 113 (2000) 4444. 6. J Sarabadani, A Milchev, and T A Vilgis, J. Chem. Phys. 141 (2014) 044907. 7. G S Grest and K Kremer, Phys. Rev. A 33 (1986) 3628. 8. D Frenkel and B Smit, “Understanding Molecular Simulation From Algorithms to Applications”, Academic Press (2001).